1480: wegen der Befürchtung weiterer Repressalien in Toledo Wechsel nach Sigüenza unter der Protektion von Kardinal Pedro Gonzalez de Mendoza, dem Bischof von Sigüenza [Miranda, s.v.]

1495: Als Cisneros von Königin Isabel I. erfährt, dass er vom Papst zum Erzbischof von Toledo ernannt worden ist, akzeptiert er diese Entscheidung nicht, so dass eine zweite Bulle, mit der Aufforderung des Papstes zu gehorchen und die Promotion zu akzeptieren, nötig wird [Miranda, s.v.].

Als Erzbischof von Toledo umfangreiches Reformprogramm, von Papst Alexander VI. mit weitreichenden Fakultäten ausgestattet und 1495-07-05 beauftragt mit der Visitation und der Reform der religiösen Orden dieses Erzbistums [Miranda, s.v.]

1497: Diözesansynode in Alcalà de Henares und

1498: Diözesansynode in Talavera, dabei neue Verfassung die von Kriterien der Seelsorge beieinflusst und wichtige Praktiken, um die Seelsorge allgemein zu verbessern auf den Weg gebracht [Miranda, s.v.]

Setzt sich energisch für die Umsetzung der seelsorgerischen Reformbestimmungen des Konzils von Trient ein. [Miranda, s.v.]

Ab 1499: auf Anweisung der Katholischen Könige persönlich eine Kampagne zur Christianisierung der Mauren in Granada geleitet, dabei heftige Tumulte und Aufstände in Granada und Las Alpajurras, während derer er in seinem Haus im Alcazaba eingeschlossen, danach zum Verlassen der Stadt gezwungen, jedoch vom Papst Gratulationen wegen tausender Konvertierter [Miranda, s.v.]

1502: Nach der Niederschlagung der Aufstände von den katholischen Königen Anweisung an den Erzbischof, dass die mudejares von Kastilien zur Konversion verpflichtet oder zur Emigration gezwungen werden sollen [Miranda, s.v.]

Nach dem Tod Königin Isabells I. 1504-11-26 weiterhin den König Ferdinand unterstützt, durch die Vermittlung Cisneros 1505-09-24 die Concordia de Salamanca erreicht, in welcher die Zwistigkeiten zwischen Ferdinand und Philipp I. gelöst, klar zu Gunsten Ferdinands [Miranda, s.v.]

1506-11-25: nach dem Tod Philipps I. als Regent Aufgabe, die von verschiedenen Faktionen des Adels bedrohte Ordnung aufrecht zu erhalten und die Rückkehr Fernandos, der sich in Neapel befand, zu beschleunigen [Miranda, s.v.]

1508: Gründung der Universität in Alcalà de Henares [Miranda, s.v.]

1516-01-23: nach dem Tod Ferdinands I. behielt Cisneros die Regentschaft von Spanien trotz des Widerstandes des Adels und sogar des Infanten Don Fernando, vom Thronerben Don Carlos erreichte er die Bestätigung seiner Regentschaft und organisierte gegen den Adel eine Bürgerarmee von 30.000 Mann, deren Aufgabe die Verteidigung der Krone war; dagegen gab es Aufstände des Adels in einigen Städten, den größten in Valladolid, Cisneros kontrollierte jedoch die Aufstände und verpflichtete den Adel, Carlos als König anzuerkennen, nicht nur als Regenten [Miranda, s.v.]

weitere wichtige Aufgabe des Kardinals: Organisation der neu eroberten Gebiete in America, ab 1500 mehrere Missonarsexpeditionen, besonders der Franziskaner gefördert, Organisation der Bischofssitze und der Kleriker, die für die Missionsarbeit bestimmt Hauptanteil seiner Bemühungen, 1516 drei Kleriker des Ordens des Hl. Hieronymus (Bernardino de Manzanedo, Luis de Figueroa und Alonso de Santo Domingo) mit präzisen Anweisungen nach America gesandt, um die Indianderdörfer und die Administration der neuen Gebiete zu reorganisieren [Miranda, s.v.]

1517-11-08: gestorben auf der Reise nach Mojados in der Nähe von Valladolid, wo er König Carlos, der 1517-09-19 in Tazones, Asturien gerade in Spanien angekommen und dessen Krone in den vorherigen Jahren durch Cisneros verteidigt, empfangen sollte [Miranda, s.v.]

1509: Einnahme der Stadt Oran; die eroberten Gebiete wurden kirchlich organisiert und dann der Diözese von Toledo zugehörig; Kampagne jedoch abgebrochen, da König Ferdinand vorhatte, Cisneros auf den Bischofsthron von Zaragoza zu versetzen und das Erzbistum Toledo dem Königssohn Alfonso von Aragon zu geben [Miranda, s.v.]

Cisneros war führend in zwei auswärtigen Kriegen: einer in Navarra, als Juan de Albret versuchte, sein Königreich zurück zu erobern, dabei Sieg für Kastilien, alle navaresischen Festungen zerstört mit Ausnahme Pamplonas; der andere im Mittelmeerraum gegen den Piraten Horuc Barbarroja, bei welchem Cisneros eine Niederlage hinnehmen musste [Miranda, s.v.]

Der Prozess für eine Seeligsprechung Cisneros’ 1530 in Toledo initiiert, im 17. Jh. gelangten die Bemühungen um diesen Prozess zu einem Höhepunkt, waren jedoch bis heute nicht erfolgreich [Miranda, s.v.].